出17：14-16 耶和华对摩西说：“我要将亚玛力的名号从天下全然涂抹了，你要将这话写在书上作纪念，又念给约书亚听。” 摩西筑了一座坛，起名叫耶和华尼西（就是“耶和华是我旌旗”的意思）；又说：“耶和华已经起了誓，必世世代代和亚玛力人争战。”
撒上15:2-3 万军之耶和华如此说：‘以色列人出埃及的时候，在路上亚玛力人怎样待他们，怎样抵挡他们，我都没忘。现在你要去击打亚玛力人，灭尽他们所有的，不可怜惜他们，将男女、孩童、吃奶的，并牛、羊、骆驼和驴，尽行杀死。’”
我们需要从几个角度来回应这样的问题。
第一个是从无神论的角度来看，因为无神论或不可知论者容易提出这样的问题，就是质疑神的慈爱等属性，并觉得神这么做是进行种族灭绝，是不对的，所以提出这样反驳。我们应该如何回应呢？
箴言26:5提到“要照愚昧人的愚妄话回答他，免得他自以为有智慧”，也就是说按照对方的愚妄或错误的方式来回应对方，让对方发现自己的愚妄，以免对方觉得自己很有智慧。如果我们仔细研究会发现，很多攻击基督信仰的说话都是自相矛盾，是站立不住的。
1、按照无神论的逻辑，是物质决定意思，世界是偶然产生的，按照进化论，一切都是优胜劣汰，也就是丛林法则。所以其实没有道德可言，一切的法则都是胜者制定的，没有凌驾于人类之上的客观的道德准则。因此我们最多说“这是我的个人意见”，我们无权对别人的行为做客观的道德性的评判，对神的作为也是如此。我们没有权利说神这样做或那样做不对，因为这等于把我们放在了比神更高的主宰的位置。
2、按照福音的第一要素，一切都是神创造的，都是属于神。说明神拥有一切的生命。神把生命和气息赐给人，也有权利以任何方式拿走人和动物的生命。如同约伯所说的：赏赐的是神，收取的也是神（伯1:21）。神不亏欠任何人。神曾经透过洪水毁灭全地，也有婴孩和母亲等。今天每天神也在透过各种方式拿走人的性命。神没有做错任何事。当我们指责神的不义的时候，其实是否认了神对万有的绝对的主权。
3、按照福音的第二要素，人人都犯了罪，亏缺了神的荣耀。所以任何人都亏欠了神，所配得的都是灭亡。因为罪的工价乃是死。神之所以没有毁灭所有人，乃是出于神的怜悯。如果神现在就毁灭所有的婴孩、母亲、牲畜，神依然是公义的、慈爱的。因为神不欠任何人。
4、亚玛力人之所以要被毁灭，是因为他们是神的仇敌，也是以色列民的仇敌。神应许以色列民及他们的列祖但凡咒诅他们的，都要被咒诅，但凡祝福他们的，都要被祝福。亚玛力人在以色列人出埃及的时候来和他们争战（出17:8；申25:17-19），所以要被神歼灭。亚玛力人是罪有应得的。
5、神也有权利透过人来施行神的审判。比如透过以色列人来审判迦南地的人。这在历史上是很特殊的例子。但是这是真实的历史。当神命令以色列人做这样的事情的时候，以色列人必须顺服，而且以色列人并没有因此犯罪。因为神总是对的。神让亚伯拉罕把儿子献上作为燔祭的时候，亚伯拉罕必须顺服，而且他也没有犯罪。唯有神是公义的，神就是公义的标准。