约12:41提到“以赛亚因为看见他的荣耀，就指着他说这话”，英文是“Isaiah said these things when he saw His glory and spoke of Him.” 这里的“他”到底是指谁呢？
当我们仔细观察经文和上下文，会发现“他”指主耶稣的可能性更大，原因如下：
1、42节开始有转折词“虽然如此/然而nevertheless”，其意思和37，39节是相反的，37，39节提到“他们不信”，42节提到“但是，还是有很多官长相信”。37,39节提到信的对象都是主耶稣，所以42节的“他”也是指主耶稣。
2、关于39-41节的背景，可以翻到以赛亚书6:1-13节，可以看到以赛亚看到了耶和华的异象，以赛亚称之为主，主因为百姓的悖逆要施行审判，让他们听却听不见，看却看不见，直到他们被驱逐到他乡。赛6:12提到了“我们”，说明这是指三位一体的神，而不仅仅是天父。
3、从其他福音书中查考这一段经文的平行经文，比如太13:10-17；可4:10-20；路8:9-10，我们可以看到耶稣用比喻对他们说，结果是他们看也看不见，听也听不明，这彰显了耶稣对他们的审判。而在约翰福音和其他福音书中，“主”这个词已经用在主耶稣的身上（约1:23；4:1；6:23；11:2；20:18,20，28；21:12；启11:8,15；17:14；19:16；22:20-21），证明旧约的主和新约的主耶稣都是主。“主”这个词的原文是“主人”“主宰”“至高的权柄”的意思，通常用在神的身上（启22:6）。用在人或天使身上的时候通常表示“先生”“主人”的意思，表示尊称（约12:21；15:20；20:15；启7:14）。
4、如果40节的“主”仅仅是指旧约的耶和华，而不是指耶稣的话，41节就显得多余，因为读过以赛亚书的人都知道，以赛亚在异象中看到的就是主的荣耀，他确实是指着主说这些话（赛6:1-13）。
5、38节在新约的平行经文是罗10:16，这里也用“主”这个词，从上下文来看，是指主耶稣，而不是天父（罗10:9,12,13）。尤其罗10:13引用的也是旧约约珥书2:32关于耶和华的经文，这里却用在了主耶稣的身上。彼得在徒2:21中提到“凡求告主名的就必得救”，其中的“主”也是指主耶稣（徒2:36）。
6、从语法的角度，41节和42节紧挨着，用的都是代词“他”。如果说前者指旧约的耶和华，后者指新约的主耶稣，这是不合理的。这两个“他”应该指同一个对象才对。这并不意味者以赛亚只看到了主耶稣的荣耀，从前面第二点可以看到是三位一体神的荣耀。
结论：41节讲的是以赛亚在异象中就看到了主耶稣的荣耀。在异象中的主是三位一体的神。这在旧约的启示中是不明显的，在新约中被更清晰地启示出来了。这也应了约翰福音起初所说的：太初有道，道与神同在，道就是神（约1:1-2）。主耶稣就是那道，他一直与神同在。阿们。